Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tnfsf9P41274 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tnfsf9P41274 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tnfsf9P41274 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tnfsf9P41274 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tnfsf9P41274 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tnfsf9P41274 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tnfsf9P41274 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms