Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms