Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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