Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NapbP28663 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NapbP28663 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NapbP28663 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NapbP28663 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms