Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms