Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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