Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms