Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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PdgfraP26618 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PdgfraP26618 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PdgfraP26618 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PdgfraP26618 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PdgfraP26618 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PdgfraP26618 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfraP26618 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PdgfraP26618 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PdgfraP26618 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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