Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChgaP26339 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms