Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VimP20152 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VimP20152 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms