Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NefhP19246 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NefhP19246 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms