Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18529 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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P18529 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18529 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18529 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms