Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd3P09027 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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