Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Zfp1P08042 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Zfp1P08042 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp1P08042 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms