Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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H2-Eb1P04230 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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H2-Eb1P04230 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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H2-Eb1P04230 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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