Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms