Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P01747 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P01747 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms