Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms