Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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BlmO88700 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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BlmO88700 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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BlmO88700 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BlmO88700 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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BlmO88700 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BlmO88700 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BlmO88700 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BlmO88700 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BlmO88700 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BlmO88700 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BlmO88700 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BlmO88700 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BlmO88700 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BlmO88700 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms