Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cops6O88545 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cops6O88545 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cops6O88545 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cops6O88545 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops6O88545 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cops6O88545 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Cops6O88545 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Cops6O88545 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops6O88545 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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