Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Stra6O70491 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Stra6O70491 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Stra6O70491 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Stra6O70491 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Stra6O70491 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Stra6O70491 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stra6O70491 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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