Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms