Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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