Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ptpn20O55082 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ptpn20O55082 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ptpn20O55082 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ptpn20O55082 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ptpn20O55082 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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