Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Copb2O55029 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms