Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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