Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
CrxO54751 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CrxO54751 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms