Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm29188-201ENSMUST00000191173 767 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms