Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms