Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clk2O35491 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clk2O35491 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clk2O35491 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clk2O35491 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Clk2O35491 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clk2O35491 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clk2O35491 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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