Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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