Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Foxd2O35392 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Foxd2O35392 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms