Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NmiO35309 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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NmiO35309 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NmiO35309 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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NmiO35309 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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NmiO35309 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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NmiO35309 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NmiO35309 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmiO35309 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NmiO35309 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NmiO35309 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NmiO35309 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms