Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smad6O35182 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms