Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kif1cO35071 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kif1cO35071 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kif1cO35071 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kif1cO35071 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kif1cO35071 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kif1cO35071 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kif1cO35071 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kif1cO35071 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif1cO35071 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms