Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LhbO09108 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LhbO09108 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LhbO09108 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms