Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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