Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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