Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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