Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm4340L7N2C4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm4340L7N2C4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm4340L7N2C4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm4340L7N2C4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4340L7N2C4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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