Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms