Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms