Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms