Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms