Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms