Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Speer4cG3UXD1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Speer4cG3UXD1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms