Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Speer4aF8VPX6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4aF8VPX6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms