Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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