Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28038F7BCN9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms