Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pgm2-202ENSMUST00000102783 2523 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ccnd2-201ENSMUST00000000188 6330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Aldoc-201ENSMUST00000017534 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ccdc171-201ENSMUST00000053414 4525 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Irx6-202ENSMUST00000167261 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms